SC²S Colloquium - March 19, 2014

Robert Hajdar: Effiziente Vektorisierung Elektrostatischer Potentialmodelle in der Molekulardynamik

Simulationen in der Molekulardynamik ermöglichen das Betrachten von physikalischen und chemischen Abläufen ohne aufwändige Laborexperimente durchführen zu müssen. Das zugrunde liegende, auf Interaktionen zwischen einzelnen Molekülen beruhende Modell bietet eine sehr hohe Auflösung, ist jedoch sehr aufwendig in der Berechnung. Das Ziel dieser Arbeit war es, elektrostatische Interaktionen zwischen starren mehrzentrigen Molekülen zu implementieren. Um diese Implementierung effizient zu gestalten, wurde sie mit Vektorinstruktionen und weiteren Optimierungen durchgeführt.